|
|
Mitochondrial genome overview Family: Cottidae Click on species name to view species information.
S.No. |
Species |
Bases composition |
Coding genes |
tRNAs No. |
rRNAs No. |
Genome size |
Accession No. |
Pubmed id |
Alignment view |
1 |
Alcichthys elongatus |
A-26.43 %, C-30.14 %, T-25.89 %, G-17.48 % |
13 |
22 |
2 |
16712 bp |
NC_082283 | - | |
2 |
Argyrocottus zanderi |
A-26.99 %, C-29.43 %, T-26.46 %, G-17.08 % |
13 |
22 |
2 |
16608 bp |
NC_057483 | 32933022 | |
3 |
Artediellus pacificus |
A-27.00 %, C-29.94 %, T-26.39 %, G-16.64 % |
13 |
22 |
2 |
17046 bp |
NC_082797 | - | |
4 |
Clinocottus analis |
A-25.36 %, C-33.50 %, T-24.12 %, G-16.98 % |
13 |
23 |
2 |
18374 bp |
NC_013828 | - | |
5 |
Cottiusculus nihonkaiensis |
A-26.31 %, C-31.49 %, T-24.74 %, G-17.43 % |
13 |
22 |
2 |
16612 bp |
NC_045245 | - | |
6 |
Cottus aleuticus |
A-26.90 %, C-29.93 %, T-26.22 %, G-16.92 % |
13 |
22 |
2 |
16540 bp |
NC_066923 | - | |
7 |
Cottus amblystomopsis |
A-25.91 %, C-30.19 %, T-26.08 %, G-17.80 % |
13 |
22 |
2 |
16528 bp |
NC_035002 | - | |
8 |
Cottus asper |
A-27.20 %, C-29.64 %, T-26.29 %, G-16.86 % |
13 |
22 |
2 |
16511 bp |
NC_036145 | - | |
9 |
Cottus bairdii |
A-27.35 %, C-29.89 %, T-26.06 %, G-16.68 % |
13 |
22 |
2 |
16529 bp |
NC_028277 | - | |
10 |
Cottus beldingii |
A-27.28 %, C-29.66 %, T-26.26 %, G-16.77 % |
13 |
22 |
2 |
16529 bp |
NC_066921 | - | |
11 |
Cottus bendirei |
A-27.26 %, C-29.91 %, T-26.11 %, G-16.70 % |
13 |
22 |
2 |
16528 bp |
NC_066919 | - | |
12 |
Cottus cognatus |
A-27.54 %, C-29.65 %, T-26.29 %, G-16.50 % |
13 |
22 |
2 |
16530 bp |
NC_068673 | - | |
13 |
Cottus confusus |
A-27.42 %, C-29.66 %, T-26.30 %, G-16.60 % |
13 |
22 |
2 |
16533 bp |
NC_066922 | - | |
14 |
Cottus czerskii |
A-26.40 %, C-30.06 %, T-26.06 %, G-17.46 % |
13 |
22 |
2 |
16534 bp |
NC_025242 | - | |
15 |
Cottus dzungaricus |
A-26.93 %, C-29.70 %, T-26.29 %, G-17.06 % |
13 |
22 |
2 |
16527 bp |
NC_024739 | 25082452 | |
16 |
Cottus gulosus |
A-27.26 %, C-29.54 %, T-26.39 %, G-16.79 % |
13 |
22 |
2 |
16518 bp |
NC_066912 | - | |
17 |
Cottus hangiongensis |
A-25.48 %, C-30.40 %, T-25.87 %, G-18.21 % |
13 |
22 |
2 |
16598 bp |
NC_014851 | 23484484 | |
18 |
Cottus hypselurus |
A-27.43 %, C-29.67 %, T-26.22 %, G-16.65 % |
13 |
22 |
2 |
16531 bp |
NC_084077 | - | |
19 |
Cottus klamathensis |
A-27.76 %, C-29.28 %, T-26.55 %, G-16.38 % |
13 |
22 |
2 |
16529 bp |
NC_066916 | - | |
20 |
Cottus koreanus |
A-26.47 %, C-29.88 %, T-26.01 %, G-17.61 % |
13 |
22 |
2 |
16558 bp |
NC_063951 | - | |
21 |
Cottus marginatus |
A-27.28 %, C-29.93 %, T-26.10 %, G-16.67 % |
13 |
22 |
2 |
16603 bp |
NC_066924 | - | |
22 |
Cottus perifretum |
A-26.97 %, C-29.81 %, T-26.13 %, G-17.07 % |
13 |
22 |
2 |
16523 bp |
NC_036146 | - | |
23 |
Cottus perplexus |
A-27.26 %, C-29.51 %, T-26.41 %, G-16.80 % |
13 |
22 |
2 |
16512 bp |
NC_066911 | - | |
24 |
Cottus pitensis |
A-27.64 %, C-29.57 %, T-26.37 %, G-16.40 % |
13 |
22 |
2 |
16513 bp |
NC_066934 | - | |
25 |
Cottus poecilopus |
A-25.68 %, C-30.38 %, T-25.74 %, G-18.18 % |
13 |
22 |
2 |
16560 bp |
NC_014849 | 23438024 | |
26 |
Cottus pollux |
A-26.44 %, C-29.88 %, T-26.01 %, G-17.65 % |
13 |
22 |
2 |
16557 bp |
NC_082940 | - | |
27 |
Cottus princeps |
A-27.83 %, C-29.41 %, T-26.43 %, G-16.31 % |
13 |
22 |
2 |
16561 bp |
NC_066915 | - | |
28 |
Cottus reinii |
A-26.30 %, C-30.28 %, T-25.78 %, G-17.63 % |
13 |
22 |
2 |
16561 bp |
NC_004404 | 12470944 | |
29 |
Cottus rhenanus |
A-27.10 %, C-29.74 %, T-26.18 %, G-16.95 % |
13 |
22 |
2 |
16522 bp |
NC_036147 | - | |
30 |
Cottus rhotheus |
A-27.22 %, C-29.94 %, T-26.11 %, G-16.71 % |
13 |
22 |
2 |
16534 bp |
NC_066913 | - | |
31 |
Cottus szanaga |
A-26.46 %, C-29.91 %, T-26.19 %, G-17.42 % |
13 |
22 |
2 |
16518 bp |
NC_032039 | - | |
32 |
Cottus tenuis |
A-27.91 %, C-29.13 %, T-26.57 %, G-16.38 % |
13 |
22 |
2 |
16518 bp |
NC_066914 | - | |
33 |
Cottus volki |
A-27.21 %, C-29.72 %, T-26.26 %, G-16.79 % |
13 |
22 |
2 |
16536 bp |
NC_035001 | - | |
34 |
Enophrys bison |
A-27.19 %, C-29.23 %, T-26.69 %, G-16.88 % |
13 |
22 |
2 |
16888 bp |
NC_066929 | - | |
35 |
Enophrys diceraus |
A-27.52 %, C-28.64 %, T-27.18 %, G-16.64 % |
13 |
22 |
2 |
16976 bp |
NC_022147 | 23901932 | |
36 |
Gymnocanthus detrisus |
A-26.72 %, C-30.13 %, T-25.71 %, G-17.42 % |
13 |
22 |
2 |
16769 bp |
NC_082787 | - | |
37 |
Gymnocanthus herzensteini |
A-26.54 %, C-30.01 %, T-25.91 %, G-17.45 % |
13 |
22 |
2 |
16691 bp |
NC_034651 | - | |
38 |
Gymnocanthus intermedius |
A-26.40 %, C-30.41 %, T-25.51 %, G-17.64 % |
13 |
22 |
2 |
16639 bp |
NC_034650 | - | |
39 |
Gymnocanthus pistilliger |
A-26.22 %, C-30.43 %, T-25.57 %, G-17.76 % |
13 |
22 |
2 |
16617 bp |
NC_082786 | - | |
40 |
Gymnocanthus tricuspis |
A-26.73 %, C-30.14 %, T-25.75 %, G-17.36 % |
13 |
22 |
2 |
16570 bp |
NC_045927 | - | |
41 |
Hemilepidotus gilberti |
A-26.75 %, C-30.39 %, T-25.82 %, G-17.01 % |
13 |
22 |
2 |
16907 bp |
NC_034653 | - | |
42 |
Hemilepidotus hemilepidotus |
A-27.09 %, C-30.31 %, T-25.80 %, G-16.79 % |
13 |
22 |
2 |
16902 bp |
NC_082813 | - | |
43 |
Hemilepidotus jordani |
A-26.73 %, C-30.13 %, T-26.01 %, G-17.11 % |
13 |
22 |
2 |
16959 bp |
NC_082782 | - | |
44 |
Hemilepidotus papilio |
A-26.63 %, C-30.29 %, T-25.81 %, G-17.26 % |
13 |
22 |
2 |
16849 bp |
NC_082785 | - | |
45 |
Icelinus borealis |
A-27.65 %, C-29.17 %, T-26.22 %, G-16.94 % |
13 |
22 |
2 |
17122 bp |
NC_082815 | - | |
46 |
Icelus spatula |
A-26.43 %, C-30.04 %, T-26.02 %, G-17.43 % |
13 |
22 |
2 |
16384 bp |
NC_027587 | 26122337 | |
47 |
Mesocottus haitej |
A-26.64 %, C-29.88 %, T-26.12 %, G-17.35 % |
13 |
22 |
2 |
16527 bp |
NC_022181 | 23901915 | |
48 |
Myoxocephalus jaok |
A-27.07 %, C-29.43 %, T-26.60 %, G-16.88 % |
13 |
22 |
2 |
16653 bp |
NC_045875 | - | |
49 |
Myoxocephalus quadricornis |
A-26.83 %, C-29.33 %, T-26.41 %, G-17.41 % |
13 |
22 |
2 |
16736 bp |
NC_053359 | - | |
50 |
Myoxocephalus scorpius |
A-27.21 %, C-29.17 %, T-26.77 %, G-16.82 % |
13 |
22 |
2 |
16626 bp |
NC_042186 | - | |
51 |
Porocottus allisi |
A-26.15 %, C-31.16 %, T-25.23 %, G-17.44 % |
13 |
22 |
2 |
16369 bp |
NC_057484 | 32933022 | |
52 |
Radulinus boleoides |
A-27.16 %, C-29.63 %, T-26.25 %, G-16.95 % |
13 |
22 |
2 |
17215 bp |
NC_082777 | - | |
53 |
Trachidermus fasciatus |
A-26.33 %, C-30.07 %, T-25.46 %, G-18.13 % |
13 |
22 |
2 |
16536 bp |
NC_018770 | 22943475 | |
54 |
Triglops forficatus |
A-26.16 %, C-30.18 %, T-25.82 %, G-17.82 % |
13 |
22 |
2 |
16861 bp |
NC_082794 | - | |
55 |
Triglops macellus |
A-25.96 %, C-30.72 %, T-25.35 %, G-17.96 % |
13 |
22 |
2 |
16808 bp |
NC_082817 | - | |
56 |
Triglops pingelii |
A-26.27 %, C-30.03 %, T-25.98 %, G-17.70 % |
13 |
22 |
2 |
16884 bp |
NC_082814 | - | |
57 |
Triglops scepticus |
A-26.87 %, C-29.32 %, T-26.37 %, G-17.42 % |
13 |
22 |
2 |
16734 bp |
NC_082789 | - | |
|